O nitrogênio tem um ciclo que acontece dentro de qualquer sistema onde existe vida aquática. Ele se inicia com a molécula de amônia (NH3). Molécula esta que é produzida pelo ciclo metabólico dos peixes ou camarões, sendo assim liberada na água. Além disso, a amônia se origina da decomposição dos resíduos orgânicos.
A quantidade de amônia presente no sistema é diretamente proporcional à biomassa, devido ao aumento da necessidade de alimento dos seres mais desenvolvidos. Portanto, o controle desta molécula torna-se essencial em qualquer sistema de criação.
O filtro correto é essencial para manter a qualidade da água no sistema. Ele é responsável pelo equilíbrio dos parâmetros da vida aquática (como por exemplo a amônia tóxica). Dentre os filtros existentes, três categorias são consideradas principais: o filtro mecânico, o biológico (composto de bactérias que fazem a decomposição de compostos nitrogenados e controle de amônia, em sua maioria de mídias MBBR) e Ultravioleta (UV), que é um esterilizador. Podem ser implementados individualmente ou associados de acordo com a necessidade específica de cada um dos cultivos.
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